Les 22 communes de l'agglO ont choisi de gérer en commun un certain nombre de compétences. Elles sont exercées de manière exclusive pour les transports urbains, la gestion des déchets, l'assainissement, le développement économique,… D’autres compétences s’exercent en appui des communes membres pour l'aménagement de l'espace, la préservation des espaces naturels, la voirie et les parcs de stationnement, l'insertion et l'emploi , l'habitat-logement, la politique de la ville. Concernant les transports urbains, 22 communes sont desservies par la SEMTAO (30 lignes de bus – 22 rames tram – 23,4 millions de voyageurs – 11 millions de km parcourus – 684 personnes).
l'AgglO délègue à la SETAO (Société d'Exploitation des Transports de l'Agglomération Orléanaise) la mise en oeuvre des transports urbains de l'agglomération. L'AgglO définit la politique transport et finance les investissements (la mise en oeuvre d'une ligne de tramway par exemple). La SETAO est la société qui exploite le réseau Bus, Tram et Parcs Relais sous la marque SEMTAO. Les élus de l'AGGLO votent les différentes décisions en matière de transport au sein de la Commission Infrastructure et Déplacement Urbain et du Conseil de Communauté.
La SETAO a mis en place une procédure pour accentuer sa politique environnementale : 10 gestes verts sont retenus : éteindre la lumière, couper la veille des appareils électriques, rouler tranquillement, démarrer en douceur, utiliser moins de papier, lutter contre les fuites d’eau et la surconsommation d’eau, économiser les cartouches d’encre, recycler les cartouches d’encre, respecter le tri établi par l’entreprise, respecter le tri des produits dangereux pour l’environnement, respecter les règles de rangement des produits chimiques.
Depuis fin 2002, la politique des transports de l’agglomération s’oriente vers des bus à énergie propre. Elle s’est concrétisée avec le lancement de l’utilisation du Diester 30% en mai 2003, afin de lutter contre les rejets de gaz à effet de serre et les émissions polluantes. Aujourd’hui 62 bus du réseau de l’agglomération orléanaise utilisent le biocarburant.